山东省阿尔茨海默病临床数据和生物样本库的构建与应用
这是一篇关于阿尔茨海默病,临床数据库,生物样本库,信息共享的论文, 主要内容为目的：建立集阿尔茨海默病(AD)及轻度认知功能障碍(MCI)患者临床、影像、生物样本等信息为一体的临床数据库和样本资源库,为AD及MCI预防、诊断、治疗及信息共享提供平台。方法：基于J2EE框架和Oracle lOg数据库,采用B/S架构,以Java为编程语言,结合AD临床诊疗特点,构建区域AD临床数据库。将山东省科技惠民项目---“山东省老年痴呆症早期防治临床医学研究平台建设”实施过程中的每一个受试者的临床资料输入本课题临床数据库及在阿尔茨海默病科技创新联盟25家医院神经内科记忆专病门诊就诊的有记忆障碍的患者的临床资料输入本课题数据库,对性别、婚姻状况、年龄、经济水平、文化程度、既往病史、生活习惯、睡眠习惯、入院诊断、血脂血糖等生化指标、头部MRI海马体积、简易神经心理量表(MMSE)、神经心理量表、治疗方式、护理方式等字段进行进行统计并作出评价。结果：1、成功构建了基于J2EE框架采用B/S架构,以Java为编程语言,结合AD临床诊疗特点,构建区域AD临床及生物样本库。2、利用本数据库,顺利完成“山东省老年痴呆症早期防治临床医学研究平台建设”及“阿尔茨海默病科技创新联盟”25家医院神经内科记忆专病门诊的临床数据及生物样本采集、整理、保存、集中管理和共享。3、共汇总录入受试者3006人(男性共1264人,女性共1736人)。认知功能筛查阳性(AD8或MMSE为阳性则为筛查阳性)1802人,占59.95%,这些人属AD或MCI高危患者。(1)阳性中男性人数为379,占30.86%；女性849人,占69.14%,提示女性是认知功能障碍的潜在高危因素。阳性组年龄均值73.47±6.60,；阴性组年龄均值67.29±4.95,提示高龄是认知障碍的潜在高危因素。(2)阳性中务农、务工、经商、在校学生、村干部(村医)、其他类的人数分别所占比例分别是91.79%、3.90%、0.33%、2.28%、0.98%、0.41%,与筛查阴性组无显著性区别,提示认知功能障碍与职业无明确相关性。(3)阳性中未婚、初婚、再婚、离婚/丧偶的人数所占比例分别是1.14%、63.12%、0.32%、35.17%,与阴性组无明显差别,提示认知功能障碍与婚姻状态无明确相关性。(4)阳性中高血压患病率为40.48%,高于阴性组中高血压患病率33.83%,提示高血压是认知功能障碍的潜在危险因素。(5)阳性组高血脂患病率15.77%,高于阴性组高血脂患病率(11.25%),提示高血脂是认知功能障碍的潜在高危因素。(6)阳性组糖尿病患病率18.86%,高于阴性组糖尿病患病率(8.39%),提示糖尿病是认知功能障碍的潜在危险因素。对样本进行代谢组学检测、分析,共得到20466个单同位素峰,与实验室中的极性物质及脂类物质库进行数据的自动匹配,共鉴定出物质701个,其中脂类物质453个,极性物质248个,使用PLS和OPLS分析数据,可以看到在OPLS得分图上,正常对照、MCI和AD都有比较明显的分离趋势。提示这些脂类代谢物有可能成为AD的早期诊断标志物。结论：1.本研究建立了基于J2EE技术框架和Oracle lOg的AD及MCI的临床及流行病学数据库。2.经数据库初步分析,确定山东省农村地区65～85岁居民AD及MCI的危险因素有：高龄、女性、低教育水平、吸烟、饮酒、高血压、糖尿病、高血脂,患者若存在一项或几项上述因素,应警惕其发展成为MCI或AD的危险。3、利用本数据库可以对山东省乃至全国农村地区老年人口进行MCI及AD的筛查。4.本研究筛选出了部分早期诊断MCI及AD的体液标志物。
利益相关者视角下医疗机构生物样本资源共享的问题与对策——以J市为例
这是一篇关于利益相关者,生物样本库,生物样本资源,共享的论文, 主要内容为生物样本资源是载有人体的遗传物质的材料及利用人类遗传资源材料产生的数据的统称,是推进生物科学研究和医学发展的重要基础。实现生物样本资源共享是提高资源使用效率,平衡资源分布的有效途径。近年来,国家大力倡导人类遗传资源共享,提出健全生物遗传资源获取与惠益分享管理制度,但仍存在生物样本库建设执行标准不同、产权归属不明等问题,进而导致样本资源统一管理难,共享成本高。另一方面,生物样本资源的共享活动涉及多个诉求不同的利益主体,包括生物样本库、生物样本使用者与捐献者等利益相关者,同时更是涉及到共享过程中的经济与社会价值合理分配,利益相关者权、责、利难以统一。因此,保证生物样本资源有效利用,实现相关者各方利益共享,充分挖掘其蕴涵的科学价值、社会价值与经济价值对于推动医学与社会发展具有重要的现实意义。J市是高度重视生物样本库建设、管理与资源共享的地区之一,具有较高的代表性。针对J市生物样本资源共享的研究与探讨,将为建立与完善生物样本资源共享的管理制度提供借鉴和参考。研究以现状调查、问题分析和对策建议的研究结构为导向,对共享活动中确定型利益相关者共享态度进行分析;基于共享流程,从统筹管理、资源整合、技术支撑、利益激励与共享文化五个方面分析问题产生的原因,最终提出有利于资源共享的对策建议。本研究发现问题表现在,一是在未有具体共享实施指南的情况下,生物样本库共享面临着投入与收益不平衡的矛盾,同时样本的共享使用也会带来巨大的伦理风险;二是使用者对生物样本资源需求旺盛,但无法合理使用,并且由于供需双方信息不对称以及样本库平台建设不规范,导致生物样本资源共享过程中的各方利益难以得到保证,临床与科研结合不紧密;三是捐赠者对生物样本资源共享抱有支持态度,但对生物样本资源共享中的风险仍有顾虑。对策建议从四个方面进行阐述,首先政府应做好顶层设计,制定共享政策指南,构建开放的共享平台,形成多方监管合力,营造安全的共享环境;再者应制定统一的生物样本库操作、管理标准,整合异质化资源,破除信息壁垒,注重人才建设,重视医学伦理,加强科研与临床协作;其次样本库需要增加对民众的宣教,普及捐赠知识,避免由于信息不对称造成的怀疑与压力;最后建立生物样本资源共享激励机制,保障相关者的利益不受损害。
生物样本库信息管理与分析系统的设计与实现
这是一篇关于生物样本库,语义相似度,人类表型本体的论文, 主要内容为当前越来越多的国家或组织建立起生物样本库(Biobank),生物样本库对于疾病的临床治疗和生命科学研究具有重要意义,同时也将会推动转化医学和个性化医疗的发展。传统的人工管理样本方式具有效率低、错误率高的缺陷,随着计算机技术的不断发展,如何通过信息化方式实现对生物样本库更加高效的管理成为了亟待解决的问题。针对这种境况,本文对生物样本库管理需求进行分析,设计并开发了一套生物样本库信息管理和分析系统。本系统可以满足生物样本库的日常管理需要,使用方便直观,运行稳定,具有良好的扩展性和移植性,可以有效提升生物样本库中对于各类样本信息的管理,同时,本系统的分析模块将有助于科研人员对样本拥有更加深刻的认知,有利于样本在科研领域中的应用。本系统可以对样本管理过程中涉及的各类信息进行有效的管理,如样本入库信息、样本出库信息、样本质检信息和容器信息。同时,除了对于样本基本信息的管理功能,本系统还拥有样本分析模块,基于人类表型本体(Human Phenotype Ontology,HPO),利用语义相似度算法寻找相似的生物样本,充分利用历史样本信息来指导新样本的存储和分析工作。本系统采用MVC(Model+View+Controller)三层架构进行设计,使用SSH(Struts+Spring+Hibernate)框架进行开发,并充分利用j Query,DWR和CSS等技术,优化用户界面,提升用户体验,并在部分模块为用户提供了可视化管理功能以方便样本管理。
山东省阿尔茨海默病临床数据和生物样本库的构建与应用
这是一篇关于阿尔茨海默病,临床数据库,生物样本库,信息共享的论文, 主要内容为目的：建立集阿尔茨海默病(AD)及轻度认知功能障碍(MCI)患者临床、影像、生物样本等信息为一体的临床数据库和样本资源库,为AD及MCI预防、诊断、治疗及信息共享提供平台。方法：基于J2EE框架和Oracle lOg数据库,采用B/S架构,以Java为编程语言,结合AD临床诊疗特点,构建区域AD临床数据库。将山东省科技惠民项目---“山东省老年痴呆症早期防治临床医学研究平台建设”实施过程中的每一个受试者的临床资料输入本课题临床数据库及在阿尔茨海默病科技创新联盟25家医院神经内科记忆专病门诊就诊的有记忆障碍的患者的临床资料输入本课题数据库,对性别、婚姻状况、年龄、经济水平、文化程度、既往病史、生活习惯、睡眠习惯、入院诊断、血脂血糖等生化指标、头部MRI海马体积、简易神经心理量表(MMSE)、神经心理量表、治疗方式、护理方式等字段进行进行统计并作出评价。结果：1、成功构建了基于J2EE框架采用B/S架构,以Java为编程语言,结合AD临床诊疗特点,构建区域AD临床及生物样本库。2、利用本数据库,顺利完成“山东省老年痴呆症早期防治临床医学研究平台建设”及“阿尔茨海默病科技创新联盟”25家医院神经内科记忆专病门诊的临床数据及生物样本采集、整理、保存、集中管理和共享。3、共汇总录入受试者3006人(男性共1264人,女性共1736人)。认知功能筛查阳性(AD8或MMSE为阳性则为筛查阳性)1802人,占59.95%,这些人属AD或MCI高危患者。(1)阳性中男性人数为379,占30.86%；女性849人,占69.14%,提示女性是认知功能障碍的潜在高危因素。阳性组年龄均值73.47±6.60,；阴性组年龄均值67.29±4.95,提示高龄是认知障碍的潜在高危因素。(2)阳性中务农、务工、经商、在校学生、村干部(村医)、其他类的人数分别所占比例分别是91.79%、3.90%、0.33%、2.28%、0.98%、0.41%,与筛查阴性组无显著性区别,提示认知功能障碍与职业无明确相关性。(3)阳性中未婚、初婚、再婚、离婚/丧偶的人数所占比例分别是1.14%、63.12%、0.32%、35.17%,与阴性组无明显差别,提示认知功能障碍与婚姻状态无明确相关性。(4)阳性中高血压患病率为40.48%,高于阴性组中高血压患病率33.83%,提示高血压是认知功能障碍的潜在危险因素。(5)阳性组高血脂患病率15.77%,高于阴性组高血脂患病率(11.25%),提示高血脂是认知功能障碍的潜在高危因素。(6)阳性组糖尿病患病率18.86%,高于阴性组糖尿病患病率(8.39%),提示糖尿病是认知功能障碍的潜在危险因素。对样本进行代谢组学检测、分析,共得到20466个单同位素峰,与实验室中的极性物质及脂类物质库进行数据的自动匹配,共鉴定出物质701个,其中脂类物质453个,极性物质248个,使用PLS和OPLS分析数据,可以看到在OPLS得分图上,正常对照、MCI和AD都有比较明显的分离趋势。提示这些脂类代谢物有可能成为AD的早期诊断标志物。结论：1.本研究建立了基于J2EE技术框架和Oracle lOg的AD及MCI的临床及流行病学数据库。2.经数据库初步分析,确定山东省农村地区65～85岁居民AD及MCI的危险因素有：高龄、女性、低教育水平、吸烟、饮酒、高血压、糖尿病、高血脂,患者若存在一项或几项上述因素,应警惕其发展成为MCI或AD的危险。3、利用本数据库可以对山东省乃至全国农村地区老年人口进行MCI及AD的筛查。4.本研究筛选出了部分早期诊断MCI及AD的体液标志物。
生物样本库信息管理与分析系统的设计与实现
这是一篇关于生物样本库,语义相似度,人类表型本体的论文, 主要内容为当前越来越多的国家或组织建立起生物样本库(Biobank),生物样本库对于疾病的临床治疗和生命科学研究具有重要意义,同时也将会推动转化医学和个性化医疗的发展。传统的人工管理样本方式具有效率低、错误率高的缺陷,随着计算机技术的不断发展,如何通过信息化方式实现对生物样本库更加高效的管理成为了亟待解决的问题。针对这种境况,本文对生物样本库管理需求进行分析,设计并开发了一套生物样本库信息管理和分析系统。本系统可以满足生物样本库的日常管理需要,使用方便直观,运行稳定,具有良好的扩展性和移植性,可以有效提升生物样本库中对于各类样本信息的管理,同时,本系统的分析模块将有助于科研人员对样本拥有更加深刻的认知,有利于样本在科研领域中的应用。本系统可以对样本管理过程中涉及的各类信息进行有效的管理,如样本入库信息、样本出库信息、样本质检信息和容器信息。同时,除了对于样本基本信息的管理功能,本系统还拥有样本分析模块,基于人类表型本体(Human Phenotype Ontology,HPO),利用语义相似度算法寻找相似的生物样本,充分利用历史样本信息来指导新样本的存储和分析工作。本系统采用MVC(Model+View+Controller)三层架构进行设计,使用SSH(Struts+Spring+Hibernate)框架进行开发,并充分利用j Query,DWR和CSS等技术,优化用户界面,提升用户体验,并在部分模块为用户提供了可视化管理功能以方便样本管理。
山东省阿尔茨海默病临床数据和生物样本库的构建与应用
这是一篇关于阿尔茨海默病,临床数据库,生物样本库,信息共享的论文, 主要内容为目的：建立集阿尔茨海默病(AD)及轻度认知功能障碍(MCI)患者临床、影像、生物样本等信息为一体的临床数据库和样本资源库,为AD及MCI预防、诊断、治疗及信息共享提供平台。方法：基于J2EE框架和Oracle lOg数据库,采用B/S架构,以Java为编程语言,结合AD临床诊疗特点,构建区域AD临床数据库。将山东省科技惠民项目---“山东省老年痴呆症早期防治临床医学研究平台建设”实施过程中的每一个受试者的临床资料输入本课题临床数据库及在阿尔茨海默病科技创新联盟25家医院神经内科记忆专病门诊就诊的有记忆障碍的患者的临床资料输入本课题数据库,对性别、婚姻状况、年龄、经济水平、文化程度、既往病史、生活习惯、睡眠习惯、入院诊断、血脂血糖等生化指标、头部MRI海马体积、简易神经心理量表(MMSE)、神经心理量表、治疗方式、护理方式等字段进行进行统计并作出评价。结果：1、成功构建了基于J2EE框架采用B/S架构,以Java为编程语言,结合AD临床诊疗特点,构建区域AD临床及生物样本库。2、利用本数据库,顺利完成“山东省老年痴呆症早期防治临床医学研究平台建设”及“阿尔茨海默病科技创新联盟”25家医院神经内科记忆专病门诊的临床数据及生物样本采集、整理、保存、集中管理和共享。3、共汇总录入受试者3006人(男性共1264人,女性共1736人)。认知功能筛查阳性(AD8或MMSE为阳性则为筛查阳性)1802人,占59.95%,这些人属AD或MCI高危患者。(1)阳性中男性人数为379,占30.86%；女性849人,占69.14%,提示女性是认知功能障碍的潜在高危因素。阳性组年龄均值73.47±6.60,；阴性组年龄均值67.29±4.95,提示高龄是认知障碍的潜在高危因素。(2)阳性中务农、务工、经商、在校学生、村干部(村医)、其他类的人数分别所占比例分别是91.79%、3.90%、0.33%、2.28%、0.98%、0.41%,与筛查阴性组无显著性区别,提示认知功能障碍与职业无明确相关性。(3)阳性中未婚、初婚、再婚、离婚/丧偶的人数所占比例分别是1.14%、63.12%、0.32%、35.17%,与阴性组无明显差别,提示认知功能障碍与婚姻状态无明确相关性。(4)阳性中高血压患病率为40.48%,高于阴性组中高血压患病率33.83%,提示高血压是认知功能障碍的潜在危险因素。(5)阳性组高血脂患病率15.77%,高于阴性组高血脂患病率(11.25%),提示高血脂是认知功能障碍的潜在高危因素。(6)阳性组糖尿病患病率18.86%,高于阴性组糖尿病患病率(8.39%),提示糖尿病是认知功能障碍的潜在危险因素。对样本进行代谢组学检测、分析,共得到20466个单同位素峰,与实验室中的极性物质及脂类物质库进行数据的自动匹配,共鉴定出物质701个,其中脂类物质453个,极性物质248个,使用PLS和OPLS分析数据,可以看到在OPLS得分图上,正常对照、MCI和AD都有比较明显的分离趋势。提示这些脂类代谢物有可能成为AD的早期诊断标志物。结论：1.本研究建立了基于J2EE技术框架和Oracle lOg的AD及MCI的临床及流行病学数据库。2.经数据库初步分析,确定山东省农村地区65～85岁居民AD及MCI的危险因素有：高龄、女性、低教育水平、吸烟、饮酒、高血压、糖尿病、高血脂,患者若存在一项或几项上述因素,应警惕其发展成为MCI或AD的危险。3、利用本数据库可以对山东省乃至全国农村地区老年人口进行MCI及AD的筛查。4.本研究筛选出了部分早期诊断MCI及AD的体液标志物。
生物样本库临床信息平台构建中的关键技术研究
这是一篇关于生物样本库,临床信息平台,IHE-PIX,数据整合与共享的论文, 主要内容为多年来,互联网的快速发展和广泛使用推进了社会信息化发展的进程,特别是“互联网+医疗”的推广与应用,加快了国内医疗信息化的速度,医疗数据资源实现迅速的积累。此外,随着生物医学基础研究、转化医学和精准医疗的深度开展,生物样本信息及其临床数据资源得到迫切的应用需求,其重要性在未来的医学研究、生物医药等领域已经获得越来越广泛的认识和重要关注。然而,目前国内尚且没有统一的标准对生物样本资源进行管理,样本数据存储分散、数据格式不一、样本信息和其相关临床数据信息之间相互独立、不能整合,这已经成为制约医学科研发展和临床诊疗实现突破的瓶颈。与此同时,也缺乏生物样本数据的标准化体系、安全规范和技术架构,缺少样本信息与其相关临床数据资料整合的技术规范。为了有效解决生物样本信息和其临床数据间难以整合互融带来的挑战,亟需构建生物样本库临床信息平台,并实现该平台的整体架构和技术架构设计,以及建立其标准规范体系。通过生物样本库临床信息平台提供的技术支撑能力和功能服务,对多医疗业务系统中的生物样本数据或其它相关数据资源进行获取、处理等,并建立平台数据中心、临床数据库等,为后续开展生物样本库系统或数据平台的应用与研究提供支持。基于目前国内生物样本库系统或资源平台的实际发展情况和应用需求,本文提出使用面向服务的体系架构(Service-Oriented Architectures,SOA),并采用分层设计策略,即主要是将生物样本库临床信息平台划分成两部分:基础支撑平台、功能性服务组件,完成了平台软件体系框架的设计和实现平台提供的主要服务功能,提高了整个平台的灵活性和可操性。基于SOA体系框架,该文以跨医疗机构的生物样本信息整合与共享服务平台为突破口,使用支持集成医疗企业-患者标识交叉索引交易(IHE-PIX)规范的患者身份识别技术,通过患者主索引将生物样本信息和患者身份关联起来,对持有不同医疗就诊卡的患者身份进行唯一性认证,从而为解决在生物样本库系统或资源平台的建设过程中遇到的样本资源存储分散、各自独立以及与其相关临床数据资源不能整合互通和共享等问题提供支持。此外,对于平台内部的数据信息在整个通信过程中所涉及的信息集成和交换标准,本文试图从技术角度完成论证。
本文内容包括但不限于文字、数据、图表及超链接等）均来源于该信息及资料的相关主题。发布者：毕设工厂 ，原文地址：https://bishedaima.com/lunwen/51564.html
